Theo Nghị quyết 08-NQ/ĐUBTC ngày 23/4/2025, Bộ Tài chính sẽ tổ chức lại các đơn vị ngành dọc ở địa phương, đảm bảo tinh gọn và phù hợp với việc tổ chức lại đơn vị hành chính các cấp trên cả nước.
Đối với cơ quan thuế và kho bạc, 20 Chi cục hiện tại sẽ được tổ chức lại thành 34 đơn vị cấp tỉnh, thành phố. Các đội thuế cấp huyện sẽ chuyển đổi thành Thuế cơ sở, thuộc quyền quản lý trực tiếp của Thuế tỉnh/thành phố, để thực hiện nhiệm vụ quản lý thuế trên địa bàn các xã, phường sau sáp nhập. Các phòng giao dịch của Kho bạc Nhà nước cấp tỉnh cũng sẽ được bố trí lại nhằm quản lý hiệu quả các đơn vị hành chính cấp xã mới.
Ở khối thống kê và bảo hiểm xã hội, Bộ Tài chính sẽ tổ chức lại 63 Chi cục thống kê và 35 BHXH khu vực thành 34 cơ quan thống kê và BHXH cấp tỉnh/thành phố. Các đơn vị cấp huyện sẽ không còn tồn tại độc lập, thay vào đó là các Thống kê cơ sở và BHXH cơ sở, trực thuộc cấp tỉnh và quản lý trực tiếp tại địa bàn xã, phường.
Hệ thống hải quan và dự trữ giữ nguyên số lượng hiện tại gồm 20 Chi cục Hải quan khu vực và 15 Chi cục Dự trữ Nhà nước khu vực, nhưng sẽ điều chỉnh địa bàn quản lý để phù hợp với đơn vị hành chính mới. Đồng thời, các chi cục này sẽ được đổi tên thành Hải quan khu vực và Dự trữ Nhà nước khu vực, đảm nhận trực tiếp việc quản lý các điểm kho.
Bộ Tài chính cũng thực hiện cải cách sâu tại cấp trung ương. Vụ Ngân sách Nhà nước sẽ được hợp nhất với Vụ Tổng hợp Kinh tế quốc dân, hình thành một đầu mối điều phối ngân sách và chiến lược vĩ mô hiệu quả hơn. Bộ sẽ tách nhiệm vụ thẩm định và giám sát đầu tư ra khỏi Vụ Đầu tư, để thành lập một đơn vị độc lập cấp Vụ, nhằm tăng cường năng lực giám sát, đánh giá đầu tư công. Thanh tra Bộ sẽ kết thúc hoạt động, đồng thời tổ chức lại đơn vị cấp phòng tại văn phòng Bộ và Vụ Pháp chế để phụ trách công tác tiếp dân, xử lý khiếu nại, phòng chống tham nhũng, tiết kiệm và chống lãng phí
